Пока еще не решенный вопрос касается нервных процессов, обусловливающих чередование медленного и быстрого (БДГ) сна. Батсел показал на собаках, что верхнему отделу ретикулярной формации свойственны спонтанные циклические колебания активности. Недавно Хобсон и другие, а также Мак-Карли и Хобсон высказали предположение, что физиологической основой цикличности сна служит двустороннее взаимодействие между нейронами голубого пятна и области под ним, с одной стороны, и нейронами гигантоклеточных полей покрышки (ГПП). Хобсон недавно предложил конкретную физиологическую интерпретацию гипотезы двустороннего взаимодействия.
Он предполагает, что «...гигантские клетки являются холинэргическими холинорецептивиыми нейронами и оказывают на постсинаптические элементы, в том числе друг иа друга, возбуждающее действие. Поэтому в популяции клеток ГПП возможно самовозбуждение. Нейроны ГПП имеют двусторонние связи с двумя группами аминэргических клеток — с нейронами в области шва и голубого пятиа, которые используют в качестве нейромедиатора иорадреналии. Обе группы аминэргических клеток угнетают активность друг друга и собственную. Поэтому в каждый данный момент возбудимость популяции клеток ГПП находится в обратной зависимости от уровня активности аминэргической популяции и наоборот».
Поведение популяций упомянутых клеток во время бодрствования, медленного сна и быстрого сна согласуется с этой моделью.